本专业以“3+1”培养方案为主导，课程体系按模块进行组合，以化学、生物学，药学及工程技术为龙头;以药物分析、生物制药技术、化学药物技术、制药工程学等课程为核心构建本专业的核心课程群。

　　本专业与北京亦庄生物医药园合作开设“生物医药园班”，2015年获评“北京市级校外人才培养基地”；2018年11月与“大兴生物医药产业基地”签订了合作育人协议，还与北京同仁堂（集团）有限责任公司、北京泰德制药股份有限公司、华润双鹤药业股份有限公司、北京红惠新医药科技有限公司、北京诺康达医药科技有限公司等多家制药企业和科研单位建立了合作关系，使学生真正参与制药工程专业的人才培养，为“卓越计划”的实施创造了良好条件。同时与中科院开展“实培计划”联合培养人才，在高水平科研平台上培养学生科研能力。

　　立足北京，面向全国，契合京津冀区域经济社会发展和医药产业需求，本专业旨在培养具有良好的职业道德、社会责任感和较强的创新精神和创业意识，具有良好的沟通能力和一定的国际视野，具备较扎实的化学、药学、生物学和工程学的基础和制药工程专业知识，能够在制药及其相关领域的生产企业、科研院所和管理部门等单位从事产品开发、工程设计、生产管理及技术服务等工作的应用型工程技术人才。

　　有机化学、物理化学、化工原理、生物化学、微生物学、药物化学、药剂学、药理学、药物分析、制药工艺学、制药分离工程、制药设备与工艺设计，制药安全与环保等。

　　中国食品药品检定研究院、北京同仁堂(集团)有限责任公司、国药集团化学试剂北京有限公司、华润集团双鹤药业股份有限公司、北京泰德制药股份有限公司、北京中卫康医药投资有限公司、北京德众万全药物技术开发有限公司、北京珐博进医药技术开发有限公司、北京利德曼生化股份有限公司等。

　　近年来学生毕业后考取研究生的主要学校有：中国药科大学、沈阳药科大学、北京化工大学、北京工业大学、中国科学院微生物研究所等。

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